Vejvanovský est considéré comme le compositeur baroque tchèque le plus important du XVIIe siècle. Il excelle dans les composition orchestrales.
Issu d'une famille modeste de Moravie, d'un père caporal de la garde municipale, il étudie au lycée jésuite d'Opava, où il fait la connaissance du compositeur Heinrich Biber, qui influence considérablement son œuvre. Après ses études, il entre au service de l'évêque d'Olomouc, et devient maître de chapelle en 1664. Sa carrière ne s'arrête
pas là, et il dirige bientôt le chœur épiscopal, ce qui signifie une nette amélioration de sa situation financière. Vejvanovský compose aussi bien des œuvres profanes, notamment des sonates et des ballets, que de la musique sacrée, comme des messes, des psaumes et des chants liturgiques. Il s'inspire des motifs de la Renaissance, et ses compositions pour cuivres sont d'une grande originalité.
A sa mort, il est un citoyen riche et respecté de la ville de Kroměříž.