Bien que les jardins Vojan soient ouverts au public depuis 1954, leur histoire remonte au XVIIe siècle. Ils comptent parmi les plus anciens jardins de la ville de Prague. D'abord plantés d'arbres fruitiers,
ils sont transformés au XIXe siècle en un parc anglais. Ils ont été rénovés après les inondations de 2002, pendant lesquelles ils ont été recouverts à certains endroits de quatre mètres d'eau.