Busverbindungen nach Prag sind nicht so häufig wie Zugverbindungen, in der Regel sind sie jedoch preisgünstiger. Die wichtigsten Busreiseunternehmen sind Student Agency und Eurolines. Der internationale Busbahnhof Florenc befindet sich praktisch
im Stadtzentrum an der gleichnamigen Metro-Station. Im Sommer verkehren auch Buslinien zu Badeorten in Süd- und Südosteuropa. Busreisen dauern meist länger als Flugreisen und können auf lange Entfernungen etwas unbequem werden.